reconcile コマンドは、vardir/log/SID_ovrNN.log に以下のようなログを出力します。
< orcl2_ovr01.log >
ovr      2018-11-07 08:57:39.764707 16711 2904885088 main_loop o->odr_seqno=3494 seqno=0 o->odr_scn=333779089 scnno=333790523 o->odr_offset=28844128 offset=-1 o->odr_op=3
上記出力は、ログ順序番号 3494 で SCN 333779089 のメッセージを削除したことを意味します。
本ログファイルの内容から進捗状況を確認してください。