以下の情報を取得してテクニカル・サポートへ送付してください。
ソース側
vardir/log/event_log
vardir/log/desvr_JOBID_*.log
ターゲット側
vardir/log/event_log
vardir/log/declt_JOBID_*.log
vardir/log/declt_JOBID_*.sql
(*)JOBID は問題が発生した compare/repair の Job ID
また、問題が再現する場合は以下の情報も取得してください。
compare コマンドのデバッグログ取得手順 (261771)