VMware社から、VMware ESXi6.0.xにおけるCBTの不具合に関するナレッジが公開されており、Plug-in for VMwareも同不具合の影響を受ける可能性があります。
VMware社にて公開されている KB#2136854:
Backing up a Changed Block Tracking enabled virtual machine in ESXi 6.0.x returns incorrect changed sectors (2136854)
VMwareのCBTを有効にしたバックアップでは、vSphere APIコールQueryDiskChangedAreas()により、変更されたディスクセクタを決定していますが、ESXi6.0.xでは、この応答に不正なディスクセクタを返すことがある事象がVMware社から報告されています。この影響を受け、Plug-in for VMwareのバックアップ(フル、増分・差分バックアップ)においても一貫性のあるバックアップが取得できずにデータロスに繋がる可能性があります。
同問題は、Plug-in for VMware の問題では無く VMwareESXi側の問題となりますので、詳細につきましては、VMware社の公開情報(KB2136854)をご確認頂きました上で必要な対処をお願い致します。
VMware社のKBに詳細は記載されておりますが、現在(2015/11/25)VMware社から同事象に関するパッチが提供されております。CBTを利用する可能性がある場合には、対処をお願い致します。
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This issue is resolved in VMware ESXi 6.0 patch ESXi600-201511001.
For more information, see VMware ESXi 6.0, Patch Release ESXi600-201511001 (2137545).
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最新の情報に関しましては、VMware社の本KBの内容をご参照ください。